Charles lahir tahun 1606 di Paris, Perancis dan berasal dari keluarga bangsawan yang kaya raya. Ayahnya bernama Jean Garnier dan ibunya bernama Anne de Garault.Ia masuk seminari Serikat Yesus di Clermont Perancis pada tahun 1624 dan ditahbiskan menjadi imam pada tahun 1635.
Sebagai seorang imam misionaris, Charles ditugaskan ke New France (Kanada) pada tahun 1636. Ayahnya melarang Charles untuk menjalankan misionaris itu karena ia khawatir akan keselamatan anaknya. Namun, melihat kegigihan dan semangat Charles, akhirnya Charles pun diizinkan berangkat ke Kanada dan tiba di misi Huron bersama Pierre Chastellain SJ. Disana Charles dijuluki Ouracha atau pembawa hujani. Hal ini karena kedatangan Charles diikuti dengan hujan yang lebat setelah mengalami kekeringan yang sangat panjang.
Kemajuan suku Huron dibawah bimbingan Charles membuat suku Iroqouis iri hati dan menganggap misionaris kulit putih adalah para tukang sihir yang bekerja untuk suku Huron dan akan mendatangkan wabah penyakit. Pada bulan Maret 1649, Charles mendengar bahwa temannya yang bernama Jean de Brébeuf SJ telah meninggal dunia. Charles pun menyadari bahwa posisinya juga berbahaya.
Maka pada 7 Desember 1649, suku Iroquois menyerang suku Huron, yang menjadi tempat pelayanan Charles. Ia tertangkap saat sedang merawat seorang Huron yang sedang sekarat. Para Iroqouis memecahkan kepalanya dengan tomahawk di dekat benteng Saint Jean, Ontario, Kanada. Charles dibeatifikasi 21 Juni 1925 dan dikanonisasi 29 Juni 1930 oleh Paus Pius XI. Charles Garnier. SJ termasuk dalam salah satu martir Amerika Utara atau martir Kanada yang pestanya juga dirayakan setiap tanggal 19 Oktober.
