Bonaventura lahir pada tahun 1221 di Civita di Bagnoregio, Negara Gereja (Papal States). Ayahnya bernama Giovanni di Fidanza dan ibunya bernama Maria di Ritella. Ketika masih muda, ia diselamatkan dari kematian melalui doa-doa kepada Santo Fransiskus dari Asisi, yang pada akhirnya menjadi motivasi utamanya dalam menulis riwayat hidupnya.
Lalu, ia memutuskan untuk masuk Ordo Fransiskan pada tahun 1243 dan menempuh pendidikan di universitas yang sama. Lalu, pada tahun 1253, Bonaventura menjabat sebagai ketua Ordo Fransiskan di Paris. Kemudian, sampai tahun 1257, Bonaventura tinggal dan kerja bersama Santo Thomas Aquinas. Bonaventura juga bertemu dan menjadi teman dari kardinal Hugh dari Saint-Cher. Tiga tahun sebelumnya, ketenarannya telah membuat Bonaventura mendapatkan posisi sebagai filsuf di buku The Four Books of Sentences – sebuah buku teologi yang ditulis oleh Peter Lombard pada abad ke-12. Pada tahun 1255, Bonaventura pun menerima gelar doktor.
Pada tanggal 24 November 1265, ia terpilih sebagai Uskup Agung York. Namun, ia tidak pernah ditahbiskan dan mengundurkan diri dari pengangkatan tersebut pada bulan Oktober 1266. Selain itu, Bonaventura berperan penting dalam pemilihan Paus Gregorius X dan ia pun mendapatkan gelar Uskup Kardinal Albano dan di tahun 1274 ia menghendaki untuk hadir dalam Konsili Lyon II. Kontribusinya yang signifikan dalam Konsili Lyon II menyebabkan penyatuan gereja-gereja Yunani dan Latin.
Bonaventura mengarahkan para Fransiskan pada jalur moderat dan intelektual yang membuat mereka menjadi ordo yang paling menonjol dalam Gereja Katolik sampai kedatangan para Yesuit. Teologinya ditandai dengan upaya penuh untuk mengintegrasikan iman dan akal budi. Ia memandang Kristus sebagai “satu-satunya guru sejati” yang menawarkan kepada manusia pengetahuan yang dimulai dari iman, lalu dikembangkan melalui pemahaman rasional, dan disempurnakan melalui persatuan mistik dengan Tuhan.
Akan tetapi, Bonaventura meninggal secara mendadak pada tanggal 15 Juli 1274 dalam keadaan yang mencurigakan, sehingga ada spekulasi yang mengatakan bahwa ia diracun.
Bonaventura secara resmi dikanonisasi pada tahun 1482 oleh Paus Sixtus IV dan diberi gelar Doktor Gereja yang terbesar oleh Paus Sixtus V pada tahun 1587. Bonaventura juga dihorrmati sebagai salah satu filsuf terbesar di abad pertengahan. Selain itu, Santo Bonaventura adalah santo pelindung gangguan usus.
